上世紀60年代，青海湖發生了一場饑荒，當地的糧食出現供應不足，甚至還出現了有人餓死的情況。而同時期，青海湖的湟魚資源可觀，於是人們便將目光投向了這種魚類。在那個饑荒的年代，湟魚起到了救濟糧食的作用，拯救了不少人的生命。
湟魚陷入危機
據當地漁民回憶，在危機最瘋狂的時候，有上萬人進入青海湖進行捕撈。在1960到1962年，青海湖湟魚的捕撈總量達7.3萬噸。
饑荒時期後，湟魚並沒有得到有效保護，在上世紀70-80年代，湟魚的價值有增無減。於是便出現了大量的偷捕、濫捕情況。於是野生湟魚的數量逐漸變少，可供捕撈的數量更是下降到了1000噸以下。
湟魚陷入危機的原因有很多，人為捕撈只是其中一個因素。據記載，青海湖的水量正在不斷減少。據研究人員統計，上世紀50年代，匯入青海湖的河流達108條，但21世紀後，匯入青海湖的河流不足10條，而湟魚產卵的河流，也只剩下了4條。
此外，湟魚的繁殖期正好是農業灌溉的重要時期，於是便出現了莊稼和湟魚爭水的情況。莊稼灌溉可能導致河水斷流，這對繁殖期的湟魚來說，簡直就是滅頂之災。為了促進湟魚產卵，政府在重點河流的大壩，修建了開放式階梯型魚道。
湟魚的保護
1980年，青海省停止了商業捕魚計劃，此後「封湖育魚」計劃拉開。在計劃期間，國營漁場將按照規定的時間、區域，限額進行捕撈，其目的主要是調節水產品市場。除此之外，其他個人及單位不得銷售湟魚產品。
從1982年起，青海共實施了5次封湖育魚計劃，時間為2-10年不等。由此可見，青海對湟魚的保護力度，一直都在不斷增加。在計劃的同時，青海湖裸鯉急救中心培育了大量魚苗。累計數量已達7600萬尾，對野生湟魚恢復率達23.53%。
到2020年，青海湖的湟魚數量已達2億尾左右，比2010年增加了210%。但目前湟魚的儲存量，和原始存儲量還有著3倍的差距。按照國際的標準來看，青海湖湟魚要想恢復商業捕撈，需達到原始資源量的50%才行，所以這次湟魚保護計劃，還需要繼續進行。
青島湖湟魚
湟魚是青島湖唯一的經濟魚類，自1958年以來，湟魚的產量達到了30萬噸，其中大部分都是為饑荒做出的貢獻。1960年，湟魚的平均產量在1萬噸左右，當時湟魚的個頭都很大，單條湟魚就可以達到1斤重。
1970年，湟魚的資源明顯下降，湟魚也出現了資源危機。1994年，湟魚被列入國家二級保護動物。2003年，被列入青海重點保護動物。
當湟魚成為保護動物後，當地漁民開始停止捕撈。湟魚是青海湖唯一的經濟魚類，對控制青海湖生態起著很大作用。湟魚一旦滅絕，青島湖將會發生嚴重的水生災害。因此，從生態的角度來說，湟魚的保護是非常重要的。